Tra i luoghi d’interesse turistico va senza dubbio segnalata la Laguna di Lesina, annoverata ufficialmente tra i laghi d’Italia, le cui acque hanno una conformazione molto simile a quella del mare, nonostante in essa sfocino diversi torrenti di acqua dolce. La laguna ospita particolari specie di fauna e flora grazie a condizioni climatiche particolari, che la rendono unica nel suo genere.

Il Castello e la chiesa Santa Maria di Ripalta, una frazione del comune di Lesina, che ha origini molto antiche. Del castello risalente al XII secolo rimane la torre, in origine alta 15 metri.
La Chiesa di Santa Maria è quello che rimane di un’antica abbazia di frati benedettini.

La Cattedrale SS. Annunziata, in stile greco romanico, costruita tra il 1828 e il 1837. Essa è sorta sulle rovine di una chiesa costruita nel 1600, sempre dedicata alla SS. Annunziata, ma poi crollata con il terremoto del 1630. Al suo interno è possibile ammirare bellissimi affreschi, che narrano la vita di Gesù.

La Chiesa di San Primiano Martire, appartenente in antichità alla Confraternita del Santo Rosario.

Suggestiva è la Croce del Campanile di San Clemente che sorge dalle acque del lago. La croce appartiene ad un antico convento costruito intorno al 1100 e poi sommerso dalle acque a causa di un maremoto.

Interessante da visitare è anche l’ex Palazzo Vescovile dove si rifugiò il vescovo di Lucera perseguitato dall’imperatore bizantino Costante II.

Bosco Isola, duna che separa la città dal mare, è considerata un vero e proprio laboratorio botanico. La flora che vi cresce è tipica della costa adriatica ma con qualche esemplare in più, come il Cisto Clusio, piccola pianta con conformazione legnosa, che potrete ammirare solamente sul territorio di Lesina.